Структура кластеров по данным численного эксперимента

^-Структуры. В работе [386] рассматривается вопрос о том, отражают ли мгновенные структуры, получаемые в процессе чис­ленного моделирования, наиболее фундаментальные особенно­сти структуры исследуемых систем — кристаллических, жидких, аморфных и т: д. Так, мгновенные /-структуры (по терминоло­гии Дж. Эйзенберга и В. Кауцмана [387]) кристаллов не обла­дают, строго говоря, ни симметрией, — ни периодичностью. Для того чтобы выявить эти присущие кристаллическому состоянию особенности, необходимо рассматривать идеализированные, на­пример усредненные по колебаниям атомов, структуры (У-струк — туры по [387]). Ю. И. Наберухин и соавт. [388] предлагают обобщить понятие V-структур на случай систем со сложным ме­ханизмом подвижности молекул, не позволяющим получить про­стым усреднением координат физически оправданные структу­ры. Одним из алгоритмов получения таких идеализированных структур, которые авторы работы [388] предлагают называть собственными, является поиск ближайшего к данной мгновенной структуре минимума потенциальной энергии. В рамках числен­ного эксперимента такой поиск может заключаться в резком понижении температуры моделируемой системы. Полученные таким образом структуры предлагается называть /7-структура — ми [386, 388]. /"-Структуры являются одной из разновидностей собственных структур. Аналогичный подход развивается в ра­ботах Ф. Стиллинджера и Т. Вебера [389—391]. Эти авторы предпочитают использовать термины «существенные» или «скры­тые» структуры. Подчеркивая роль этих исследований в разра­ботке концепции собственных структур, автор предлагает назы­вать областями Стиллинджера — Вебера области в конфигура­ционном пространстве, соответствующие данной собственной структуре (например, /"-структуре) [386].

Таким образом, в исследовании структуры любой конденси­рованной фазы можно выделить два уровня: 1) изучение собст­венных структур и 2) изучение их термических возбуждений или флуктуаций (мгновенных структур). В случае структур кристал­лических объектов эти уровни описания называют иногда стати­ческими (1) и динамическими (2) структурами (см. например, работу [392]). Ниже мы проиллюстрируем эффективность тако­го подхода к структурам некристаллических объектов — класте­ров, содержащих молекулы воды.

Нами было предпринято моделирование кластеров (Н20)п (п = 2-^20) с помощью одного из наиболее распространенных методов численного эксперимента — метода Монте-Карло. При этом использовалась стандартная процедура Метрополиса и др. [393]. Конкретный вариант этой процедуры описан в других на­ших публикациях [386, 394—396]. Расчеты проводили с по­мощью потенциалов, характеризующих взаимодействие между молекулами воды: потенциалов (1), ([394], см. также [386]) и по­тенциалов (2), описанных в работе [397]. В первом случае молекулы воды представлены системой четырех точечных заря­дов ±0,195 е (е — заряд электрона), расположенных в верши-

Таблица 8.4. Некоторые характеристики


Число водо­родных свя­зей ЛНВ

Тип конфигурации

(2)

Потенциальная энергия —U, кДж/моль

(1)

6

7 9[2]

8

179,6

177.5

174.6

168.7

179,6 183,4 187,6 184,2

Гексагональное кольцо Два квадрата с общим рядом Тригональная призма Октаэдр

F-структур кластеров (Н20)6

Сумма энергий во­дородных связей, —2£нв

У/л

—2£нв/янв

ZEhbIU

(1)

(2)

(і)

(2)

(1)

| ■ (2)

(І)

(2)

155,5 164,1

150,9

157,0 171,7

174,2

30.0 29,6

29.1 28,0

30,0 23,4 31,3 30,7

25,9 23,4

18,9

29,0 24,5

21,8

0,86 0,92

0,89

0,88 0,94

0,94

Имеет расстояние /?00=335 пм, так что может считаться разорванной.

Нескольких, близких по энергиям, конфигураций кластера (Н20)л проиллюстрируем на примере п=6. Характеристики не­которых ^-структур гексамеров из молекул воды приведены в табл. 8.4. При расчетах с потенциалами (1) наиболее выгодным оказывается почти плоское шестичленное кольцо, а при исполь­зовании потенциалов (2) преимущественно устойчивы структу­ры с максимально большим числом водородных связей, хотя и искаженных, углы между которыми сильно отличаются от тет — раэдрических.

Среди кластеров (Н20)в наиболее устойчивы такие, в кото­рых молекулы расположены по углам лишь незначительно иска­женного куба. В этих кластерах каждая молекула участвует в образовании трех водородных связей. В табл. 8.5 приводятся данные для кубического кластера, содержащего 12 водородных связей, и для октамера Стиллинджера — Дэвиса с девятью во­дородными связями.

Таким образом, потенциал MCY, широко используемый для моделирования водных систем [379], дает для кубического клас­тера результаты, близкие к полученным с нашими эксперимен­тальными потенциалами (1) и (2). Что касается поляризацион-

Таблица 8.5. Некоторые F-структуры кластеров (Н20)ь

Кластер

Потенциал

—В, кДж иа 1 моль кла­стеров

—Е/п, кДж иа 1 моль мо­лекул

Кубический

(1) (2)

MCY [3831

287,6

296.4

280.5

35,9

37.0

35.1

Стиллинджера — Дэвида

(1)

(2)

Поляризационная модель [3821

249,5 251,5 304,9

31,19

31,4

38,1

Ной модели, то она не была использована для расчета кубиче­ского кластера.

Итак, на поставленный выше вопрос, что лучше: больше «плохих» водородных связей или меньше «хороших», оконча­тельного ответа дать нельзя. По-видимому, циклические триме — ры в действительности не являются столь стабильными, как это следует из расчетов с потенциалами (2) (см. табл. 8.3), а, сле­довательно, и кластеры, содержащие такие тримеры (см. две последние строки в табл. 8.4).

/-Структуры. Результатом численного эксперимента является набор конфигураций моделируемой системы, т. е. набор /-струк­тур. Чтобы этот набор был представительным, необходимо, что­бы он содержал достаточно большое количество /-структур (по крайней мере, несколько сот тысяч), относящихся ко многим различным областям Стиллинджера — Вебера. Закономерности структуры ансамблей /-структур носят статистический характер и описываются различными функциями распределения.

Моделирование кластеров из молекул воды выполняли мно­гие авторы, начиная с 1974 г. Они использовали различные по­тенциальные функции и конкретные алгоритмы моделирования [398—405]. В работах [398, 400] применялись методы Монте — Карло, а в работах [399, 401—405] проводили молекулярно-ди- намическое моделирование.

Для интерпретации структурных результатов численных экс­периментов очень важен вопрос формального определения водородной связи между молекулами воды. При анализе/-струк­тур водородная связь вообще не может быть определена одно­значным образом [386, 405, 406]. Это заключение согласуется с выводом Ю. И. Наберухина о том, что водородная связь мо­жет быть строго определена только для собственных структур, в частности, для /"-структур [383]. Тем не менее вопрос о водо­родных связях в ансамбле /-структур столь важен, что, начи­ная уже с первых работ по моделированию водных систем, пред­лагались различные подходы к их поиску. При этом наметились две группы критериев водородных связей: энергетические и гео­метрические. Согласно геометрическим критериям, любая пара молекул считается соединенной водородной связью, если рас­стояние между атомами кислорода, угол О—Н… О и (или) рас­стояние между атомом водорода и атомом кислорода не выхо­дят за пределы некоторых значений, установленных на основа­нии анализа данных о структурах кристаллов. Поскольку струк­туры кристаллов — это собственные (V) структуры, то прямое перенесение полученных для них зависимостей на мгновенные (/) структуры, собственно говоря, не правомерно. Согласно энер­гетическим критериям, любая пара молекул, энергия взаимодей­ствия которой ПО модулю больше некоторой величины t»HB, счи­тается соединенной водородной связью. Энергетический крите-

Таблица 8.6. Средние числа водородных связей пнв, в которых участвует молекула воды в кластерах (Н20)п, полученные с использованием парных энергетических критериев

«нв*, кДж/моль

ПнЗ при п.

Равном

5

9

15

22

30

8,37

0,9

1,2

1,4

1,5

1,6

12,56

0,6

0,9

1,1

1,3

1 3

16,75

0,3

0,6

0,7

0,9

0,9

20,93

0,1

0,2

0,2

0,3

0,4

«Критерий» GoH

0,9

1,2

1,7

1,6

1,8

* В оригинальной работе [399] величины энергетического критерия кнв приведены в ккал/моль.

Рий еще более условен, чем геометрический. Для примера при­ведем таблицу 8.6, заимствованную из работы [399].

Авторы работы [399] попытались использовать также незави­симый от критериев способ определения числа водородных свя­зей, основанный на вычислении площади под первым максиму­мом пика функции распределения расстояния /?он(£он). На ус­ловность и неоднозначность методов подобного рода для анали­за структурных особенностей ансамблей /-структур уже указы­валось ранее [386]. Обратим внимание, что применение «крите­рия £он» приводит к числу водородных связей, равному или даже большему, чем полученное с энергетическим критерием VHB= = 8,37 кДж/моль (2 ккал/моль). Как показывает опыт числен­ного моделирования, среди пар молекул, энергия взаимодейст­вия которых близка к этому значению, встречаются такие, кон-

ОС

Структура кластеров по данным численного эксперимента

Рис. 8.1. Двумерное распределение характеристик, определяющих взаимное

Расположение молекул во всех парах молекул кластера (Н20)і3. Показана часть распределения для молекул, расстояние между которыми не превышает 450 пм. Температура моделирования 300 К, потенциалы (1). Средняя потенциальная энер­гия кластера 308,2 кДж/моль, среднее число водородных связей в кластере (геометриче­ский критерий) 14,2. По оси абсцисс — расстояния О… О в пм, по оси ординат — углы О—Н… О в градусах. Вероятности соответствующих конфигураций показаны отдельно

Фигурация которых явно не отвечает возможности образования водородной связи.

Условность геометрических критериев наглядно иллюстриру­ет рис. 8.1, на котором показано двумерное распределение рас­стояний Roo и углов О—Н… О, полученное нами при модели­ровании кластера (Н20)і3. Пик этого распределения, отвечаю­щий образованию водородных связей, не имеет четких границ.

Автором и сотр. [405] предложен динамический критерий во­дородной связи, основанный на анализе не только данной кон­фигурации, полученной в ходе молекулярно-динамического моде­лирования, но и ее предыстории и ее дальнейшей «судьбы». Построение временных зависимостей энергий взаимодействия двух молекул в большинстве случаев позволяет судить о том, су­ществует ли прн данной конфигурации водородная связь, в ка­кие моменты времени она возникла и когда была разорвана (рис. 8.2). Как и всегда при рассмотрении ансамбля /-структур, при использовании этого подхода могут возникать сомнитель­ные случаи. Однако такие случаи редки и по степени определен­ности поиска водородных связей «динамический» критерий при­ближается к анализу F-структур.

Что касается распределений геометрических характеристик водородных связей в малых кластерах из молекулы воды, то они, при использовании одной и той же модели взаимодействия, мало зависят от числа молекул в кластере и почти не отличают­ся от полученных при моделировании объемной воды. Так, дву­мерное распределение, показанное на рис. 8.1, характеризует и кластеры с иным числом молекул воды и объемную воду (моде­лируемую в численном эксперименте как система с периодиче­скими граничными условиями).

Г, В

О

Структура кластеров по данным численного эксперимента

Структура кластеров по данным численного эксперимента

Рис. 8.3. Распределение геометрических характеристик в кластерах: с —расстояний R00 Б — углы О—Н…О. / — кластер (Н20)ю; 2 — Na(H20)i5; 3 — K(HsO)u. Метод Монте-Карло, Г=300 К; / — усреднение по 105 конфигурациям; 2 и 3

По 1,5- 10s конфигурациям

А, г(лд

На рис. 8.3 показаны одномерные распределения величин Roo И углов О—Н…О, полученные для температуры 300 К. Форма этих распределений, естественно, зависит от температуры [395]. Ее понижение приводит к изменению соответствующих пиков. При температурах ниже 100 К максимум двумерного распреде­ления, отвечающий водородным связям, выявляется четко и ока­зывается окруженным зоной с почти нулевой вероятностью встре­чаемости соответствующих конфигураций. Этот результат обо­сновывает правомерность утверждения, что при рассмотрении

F-структур (получаемых охлаждением моделируемой системы) выявление водородных связей производится почти однозначно.

Сходство распределений геометрических параметров водород­ных связей в малых кластерах и в объемной воде приводит к тому, что характер окружения молекул в центральных областях кластера и в объемной воде практически одинаков. Об этом сви­детельствует и сходство функций распределения расстояний Roo(Goo), Янн(ённ) И /?он(£он). Разумеется, ограниченный раз­мер кластеров и малое число молекул воды в них сказывается на высоте пиков, отвечающих дальным корреляциям. Так, со­гласно [399], второй пик на функции Goo вообще не виден для кластеров (H20)g и в меньших, но для кластеров (H20)is он вы­ражен уже достаточно точно.

Структура кластеров по данным численного эксперимента

Рис. 8.4. Распределение углов, образуемых дипольным моментом молекулы воды с радиусом-вектором, соединяющим центр системы с атомом кис­лорода.

Кластер (НгО)ю, Г=300 К, потенциалы (1). Распределение построено для молекул, на­ходящихся в сферическом слое между сферами радиусами 350 и 400 пм. Усреднение по

10s конфигураций

Но, разумеется, наличие границы сказывается на структуре кластеров. В объемной воде ориентация молекул воды, естест­венно, хаотична. В кластерах наблюдается преимущественная ориентация диполей молекул параллельно границе кластера [401, 402, 404]. При этом обнаруживается стремление атомов водорода молекул воды находиться на периферии кластера [400, 402, 404]. В проведенных нами численных экспериментах с ис­пользованием других потенциальных функций — потенциалов (1) [393] — эти выводы были подтверждены (рис. 8.4); это свиде­тельствует о том, что количественные результаты численного эксперимента справедливы для широкого класса потенциальных функций. Границы кластеров выражены достаточно четко, о чем свидетельствует резкое спадание их средней плотности на неко­тором расстоянии от центра масса [402, 404].

Комментирование и размещение ссылок запрещено.

Комментарии закрыты.